六角恐龙鱼是分公母的，它们不是雌雄同体的生物，而是雌雄异体的动物。而且它们是需要一公一母才能进行繁殖的。
六角恐龙鱼公母的外形和特点有很大的不同，不过在它们幼年时期基本是无法判断的。
一般情况下，六角恐龙鱼5-6个月的时间就可以发育成熟，成年以后公母的特点就会变得比较明显。
1、看体型：在同一环境下生长的六角恐龙鱼，公鱼的外形看起来是比较纤长的，看起来比较苗条的。母鱼的身体是比较丰满和肥大的。两者相对比，很容易就可以看得出来。
2、看泄殖孔：六角恐龙鱼公鱼的生殖孔比较突出，成年以后也比较明显，不过它们的排泄孔离后腿是比较远的。母鱼的生殖孔部位则比较平坦，但是排泄孔的位置是离后腿比较近的。如果不仔细观察的话，是很难发现的。
