变异大鳄龟是由普通的鳄龟变异而来的，主要是基因突变和杂交产生的。大多数变异的大鳄龟都是色素发生了改变，也可以说这些变异的大鳄龟出现的原因是缺乏色素。通常判断大鳄龟是否变异，都是看它们的口腔是不是淡色。由于变异的程度不同，所以变异大鳄龟的体色也不同。有一些变异的大鳄龟背甲是金色的，还有一些是粉色的。
大鳄龟变异的情况并不常见，所以很难人为的控制大鳄龟的品种。不过变异的大鳄龟有一定的遗传基因，要想繁殖出变异的大鳄龟，可以选择让普通的鳄龟与大鳄龟一起交配。除此之外，也可以选择近亲的大鳄龟一起交配，这样也能得出变异的大鳄龟。变异大鳄龟和普通大鳄龟并没有太大区别，由于是近亲繁殖，变异大鳄龟饲养的难度也会提升很多。
