乌龟清肠前期的粪便和正常的粪便并没有太大的区别，都是灰色和黑色的条状，看起来个小香肠的形状比较相似。
到了清肠的中期，乌龟的粪便就会变成絮状，基本上不会成型，颜色也会变成黄色或深褐色。
到了清肠的后期，基本上就观察不到它们的粪便了。因为它们排泄的数量会很少，而且比絮状物也会更小一些。
乌龟清肠一般情况下需要1周的时间，清肠是冬眠的最后一个步骤。为了让乌龟安全的过冬，饲养者需要先停止喂食7天左右，这样可以让它们将体内的食物全部清除干净，避免停留在肠胃导致消化疾病。如果有条件的话，清肠的时间可以长一些，2个周左右最好。这样乌龟可以整体循环一遍，冬眠以后会更加舒适。给乌龟清肠的时候，直接将它们放在温水中浸泡就可以。
